水培君子兰，不能直接取用自来水，必须用“困”过的水，所谓“困”水，就是把自来水放在容器中，在阳光下晒上3—5天，使对君子兰根部有害的漂白粉等氯化物沉淀。“困”过的水，从外表上看，沉淀物由条状变成团状，水的颜色以绿为佳。“困”好水后，淹没根部位置一定不能淹没假鳞茎。水位过浅不能使君子兰得到充分的水分供应，水位过深（淹没了假鳞茎）又会造成根部溃烂。
在养殖程中，要注意多观察水质的变化，发现根部有些发黄或变黑，说明水中既缺氧又少肥，必须立即换水。空气、阳光、温度 能否处理好水培兰根部的通气，是水培成败的关键。水培兰经过一段时间的养殖，根部便生出一层青苔，青苔过厚时会严重影响根的呼吸，并腐蚀培养液。这时，需要用柔软干净的毛刷轻轻刷去部的青苔层（不必刷得很干净，因根部有少量青苔影响不大）。
此外，还要时常检查水中的氧气是否够用。检查的方法是：向水培箱中放进两三条小鱼，如果小鱼在水中自由自在的游来游去，说明水中不缺氧，如果小鱼总是浮上水面，嘴和腮露出水面呼吸，说明水中缺氧。发现水中缺氧后，必须补氧，方法有两种，一是换水，二是用小氧泵向水中供氧。(www.66077.cn)
在阳光的处理上，君子兰是半阴办阳植物，要注意光照，特别是夏季，要避开直射的强烈阳光，使之接受散射光照。此外，根据君子兰叶片的向光特性，要注意使叶片受光均匀，否则叶片长度不一，生长方向也会前后错落，一般每隔两三天就要调整一次光照角度。
在温度处理上，成龄君子兰的环境温度以11℃－25℃为好，小苗可稍高些，20℃－35℃就可以。水中养兰要掌握昼夜温差，冬季白天保持20℃左右，夜间不低于15℃为好。
